O Pantanal é considerado um ecótono (complexo de ecossistemas) pois trata-se de uma região de encontro entre 5 biomas: Cerrado, Chaco, Amazônia, Mata Atlântica e Bosque Seco Chiquitano. Veja algumas características:
Cerrado
O Cerrado faz fronteira com toda a borda leste, sul e parte norte do Pantanal. Esse é um dos motivos pelo qual a planície tem grande influência da vegetação do Cerrado e inclusive de sua resiliência ao fogo.
O Cerrado é o segundo maior bioma da América do Sul, perdendo apenas para a Amazônia, ocupando cerca de 2.000.000 km², aproximadamente 22% do território nacional. Este bioma cobre os estados de Tocantins, Mato Grosso, Mato Grosso do Sul, Goiás, Maranhão, Minas Gerais, Rondônia, Bahia, Piauí, Paraná, Distrito Federal e São Paulo, além de manchas em Roraima, Amapá e Amazonas. Nele encontram-se as nascentes das três maiores bacias hidrográficas da América do Sul (Amazônica/Tocantins, São Francisco e Prata), destacando-se por seu grande potencial hídrico, que favorece a proliferação da vida.
Este ecossistema é um dos hotspots de biodiversidade mundial. O Cerrado, considerado a savana mais rica do mundo, abriga mais de 11.500 espécies de plantas nativas catalogadas, cerca de 200 espécies de mamíferos, 837 espécies de aves, 1.200 espécies de peixes, 180 espécies de répteis e mais de 150 espécies de anfíbios. Com diversas espécies endêmicas, destaca-se com 28% dos anfíbios e 17% dos répteis sendo exclusivos do bioma. Contudo, o Cerrado é um dos biomas mais ameaçados do Brasil, com quase 140 espécies da fauna em risco de extinção. Após a Mata Atlântica, é o bioma brasileiro mais alterado pela ocupação humana, principalmente devido à expansão agropecuária. É considerado um dos 25 ecossistemas mundiais com alto risco de extinção, com apenas 8,21% de seu território protegido por Unidades de Conservação.
Amazônia
Já a Amazônia divide a fronteira noroeste do bioma, onde a influência na vegetação nos permite encontrar exemplares de Vitória-régia (Victoria amazonica), ao longo do Rio Paraguai, descendo até a Serra do Amolar.
A Amazônia, também chamada de Floresta Amazônica, é o maior bioma do Brasil. Composta por árvores de folhas grandes e largas, está situada em uma região muito úmida que abrange grande parte da Bacia Amazônica, a maior bacia hidrográfica do mundo, cobrindo cerca de 6 milhões de km² com 1.100 afluentes. Ocupando mais de 4 milhões de km², é o bioma com a maior biodiversidade do mundo, abrigando cerca de 45 mil espécies de plantas e animais vertebrados, representando aproximadamente 20% da biodiversidade global. Na Amazônia, as onças-pintadas reinam como predadoras de topo, desempenhando um papel crucial na regulação da cadeia alimentar. As maiores populações de onças-pintadas estão localizadas na Amazônia, com densidades de 1-2 indivíduos por 100 km², podendo ser maiores em áreas alagáveis e bem preservadas.
Mata Atlântica
Os encraves de Mata Atlântica podem ser encontrados em regiões vizinhas ao Pantanal, como a Serra da Bodoquena, além de regiões dentro do Pantanal, na Serra do Amolar.
A Mata Atlântica é um bioma que cobre mais de 1,3 milhões de km², cerca de 15% do território brasileiro, espalhando-se por 17 estados, dos quais 14 são costeiros. É uma das florestas mais ricas em diversidade de espécies, abrigando cerca de 35% das espécies existentes no Brasil, incluindo muitas endêmicas e ameaçadas de extinção. Composta por formações florestais nativas, como as matas de araucárias, e ecossistemas associados, como manguezais e restingas, a Mata Atlântica sofreu intensos impactos ambientais, desmatamento, ocupação humana, agricultura, agropecuária e exploração predatória de madeira. Hoje, restam apenas 24% da área original, fazendo dela o bioma mais ameaçado do Brasil. A onça-pintada, por exemplo, está gravemente ameaçada, com estimativas de menos de 300 indivíduos restantes, o que coloca a espécie em risco iminente de extinção sem intervenções conservacionistas. A principal ameaça no bioma é a perda de habitat e a caça.
Chaco
O Chaco, a maior floresta tropical seca da América do Sul, faz fronteira com o Pantanal no Paraguai e na Bolívia. Porém, apesar de não ser reconhecido oficialmente como um bioma no Brasil, existe uma pequena porção de Chaco que ocorre dentro do território nacional, em algumas regiões do município de Porto Murtinho – MS.
Bosque Chiquitano
Da mesma forma que o Chaco, o Bosque Chiquitano ocorre prioritariamente no território Boliviano, mas uma porção desta eco região adentra o território brasileiro. Trata-se de uma floresta que funciona como uma zona de transição entre o bioma úmido Amazônico e as florestas secas do Chaco.
